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RColorBrewer是一个R颜色包,使用http://colorbrewer2.org/这个网站提供的颜色。我们画一个包括八个box的boxplot时,或者在x-y散点图上画六条线时,该怎样选择颜色呢?这个包就可以帮你。
=======哪些颜色系可以使用?=======
让我们先看看RColorBrewer给我们提供了哪些颜色系。将如下代码写进test.R并运行。(运行方式:RCMD BATCH test.R)### Load the package or install if not present
if (!require(\"RColorBrewer\")) {
install.packages(\"RColorBrewer\")
library(RColorBrewer)
}
### Set the display a 1 by 1 grid
par(mfrow=c(1,1))
#比如mfrow(2,3)就是指将绘图区域分成2行3列,并按行的顺序依次绘图填充;
### Show all the colour schemes available
display.brewer.all()
运行后生成的Rplots.pdf显示如下:Sequential,按顺序渐变的。- Light colours for low data, dark for high data
Diverging,彼此之间差异变化较大的。- Light colours for mid-range data, low andhigh contrasting dark colours
Qualitative,这个用于最大程度地显示不同类之间的差别。- Colours designed to give maximum visual difference betweenclasses
=======如何使用RColorBrewer?=======
还是举例说明。运行如下代码。### Load the package or install if not present
if (!require(\"RColorBrewer\")) {
install.packages(\"RColorBrewer\")
library(RColorBrewer)
}
### Set the display a 1 by 1 grid
par(mfrow=c(1,1))
### Generate random data matrix
rand.data -replicate(8,rnorm(100,100,sd=1.5))
### Draw a box plot, with each box coloured by the \'Set3\'palette
boxplot(rand.data,col=brewer.pal(8,\"Set3\"))结果如下:我们生成了8组随机数,然后作boxplot.col=brewer.pal(8,\"Set3\")表示使用Set3的8种颜色。
=======其他画图函数中的使用=======
除了boxplot,其他的画图函数中也能使用RColorBrewer。### Load the package or install if not present
if (!require(\"RColorBrewer\")) {
install.packages(\"RColorBrewer\")
library(RColorBrewer)
}
### Set the display a 2 by 1 grid
par(mfcol=c(2,1))
### Generate random data matrix
rand.data -replicate(8,rnorm(100,100,sd=1.5))
### Draw plot of counts coloured by the \'Set3\'pallatte
br.range -seq(min(rand.data),max(rand.data),length.out=10)
results - sapply(1:ncol(rand.data),function(x)hist(rand.data[,x],plot=F,br=br.range)$counts)
plot(x=br.range,ylim=range(results),type=\"n\",ylab=\"Counts\")cols -brewer.pal(8,\"Set3\")
lapply(1:ncol(results),function(x)lines(results[,x],col=cols[x],lwd=3))
### Draw a pie chart
table.data - table(round(rand.data))
cols -colorRampPalette(brewer.pal(8,\"Dark2\"))(length(table.data))
pie(table.data,col=cols)
结果如下:=======颜色不够用怎么办?=======
使用colorRampPalette可以扩展颜色。if (!require(\"RColorBrewer\")) {
install.packages(\"RColorBrewer\")
library(RColorBrewer)
}
### Set the display a 1 by 1 grid
par(mfrow=c(1,1))
newpalette -colorRampPalette(brewer.pal(9,\"Blues\"))(10)
### Generate random data matrix
rand.data -replicate(10,rnorm(100,100,sd=1.5))
### Draw a box plot, with each box coloured by the\'newpalette\' palette
boxplot(rand.data,col=newpalette)
运行结果如下:colorRampPalette将Blues系列的第九个颜色进行了延伸,产生了10种渐变色。
Ps:
两种方式cols -colorRampPalette(brewer.pal(9,\"Blues\"))(10)
圆括号指定有几个点或线用画颜色cols - brewer.pal(8,\"Set3\")[X]
[]指定调用其中的第几个颜色
参考资料:87%完美的日子http://blog.sina.com.cn/s/blog_681aaa5501016tk4.html
本文链接: http://brewer.immuno-online.com/view-742486.html